尼莎颱風及海棠颱風雙颱侵台後，夾帶驚人的雨量，原水濁度與水中微生物也跟著飆高，對此，環保署指出，颱風期間以及颱風過境以後，災後因消毒藥劑量增加，使得自來水中消毒藥水味會比平時重，提醒民眾宜在燒開水煮沸後開蓋再煮三分鐘以上，讓毒物揮發，藉此保障飲水安全。

環保局也強調，民眾因擔心災後水質差，而選擇飲用山泉水，那更應該確實煮沸後才飲用，此外，災後因水源濁度消毒劑量較平常高，若感覺消毒劑味道較濃，可多煮沸3-5分鐘，讓消毒藥劑揮發變少後再喝。

此次颱風也造成許多地區有淹水的現象，淹水地區的水塔清洗蓄水池若遭受污水侵入，應確實請清潔公司清洗消毒後再蓄水，並將水徹底煮沸後再飲用，以確保飲用水安全。

而大樓外牆清洗、公寓的水池、水塔等設施，務必得用清水洗淨後，加入稀釋過的漂白粉或漂白水進行噴霧消毒，或是用尼龍刷刷洗兩次，每次間隔約30至60分鐘，將清洗液排掉後再另行蓄水。